東京工科大学 研究報告等
吉田 亘
所属 応用生物学部 応用生物学科
職種 教授
言語種別
英語
発行・発表の年月
2018年02月
形態種別
学術論文
査読
査読あり
標題
Identification of G-quadruplex clusters by high-throughput sequencing of whole-genome amplified products with a G-quadruplex ligand
執筆形態
共著
掲載誌名
Scientific Reports
出版社・発行元
Springer Nature
巻・号・頁
8,3116
著者・共著者
Yoshida W.*
, Saikyo H., Nakabayashi K., Yoshioka H., Bay D.H., Iida K., Kawai T., Hata K., Ikebukuro K., Nagasawa K., Karube I.
概要
全ゲノム増幅反応をDNA四重鎖に結合する化合物中で行い、それを次世代シークエンサーで解析することにより、ゲノム中に含まれるDNA四重鎖構造を網羅的に同定する方法を開発した。これを用いてヒトゲノムDNAを解析した結果、G4構造形成配列が密に存在する領域を9,651箇所同定し、そのうち3766箇所は転写開始点近傍に存在することを明らかにした。
論文(査読付)ファイル
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外部リンクURL
https://www.nature.com/articles/s41598-018-21514-7